Protein–RNA interactions for Protein: P47872

SCTR, Secretin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCTRP47872 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCTRP47872 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCTRP47872 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCTRP47872 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCTRP47872 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCTRP47872 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCTRP47872 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCTRP47872 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCTRP47872 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCTRP47872 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCTRP47872 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCTRP47872 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCTRP47872 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCTRP47872 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCTRP47872 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCTRP47872 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCTRP47872 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCTRP47872 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCTRP47872 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCTRP47872 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCTRP47872 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCTRP47872 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCTRP47872 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCTRP47872 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCTRP47872 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCTRP47872 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCTRP47872 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCTRP47872 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCTRP47872 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCTRP47872 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCTRP47872 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCTRP47872 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCTRP47872 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCTRP47872 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCTRP47872 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCTRP47872 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCTRP47872 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCTRP47872 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCTRP47872 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCTRP47872 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCTRP47872 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCTRP47872 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCTRP47872 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCTRP47872 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCTRP47872 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCTRP47872 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCTRP47872 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCTRP47872 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCTRP47872 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCTRP47872 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCTRP47872 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCTRP47872 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCTRP47872 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCTRP47872 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCTRP47872 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCTRP47872 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCTRP47872 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCTRP47872 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCTRP47872 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCTRP47872 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCTRP47872 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCTRP47872 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCTRP47872 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCTRP47872 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCTRP47872 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCTRP47872 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCTRP47872 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCTRP47872 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCTRP47872 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCTRP47872 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCTRP47872 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCTRP47872 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCTRP47872 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCTRP47872 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCTRP47872 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCTRP47872 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCTRP47872 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCTRP47872 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCTRP47872 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCTRP47872 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCTRP47872 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCTRP47872 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCTRP47872 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCTRP47872 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCTRP47872 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCTRP47872 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCTRP47872 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCTRP47872 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCTRP47872 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCTRP47872 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCTRP47872 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCTRP47872 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCTRP47872 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCTRP47872 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCTRP47872 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCTRP47872 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCTRP47872 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCTRP47872 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCTRP47872 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCTRP47872 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms