Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTSKP43235 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTSKP43235 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTSKP43235 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTSKP43235 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTSKP43235 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTSKP43235 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTSKP43235 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTSKP43235 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTSKP43235 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTSKP43235 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTSKP43235 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTSKP43235 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTSKP43235 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTSKP43235 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTSKP43235 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTSKP43235 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTSKP43235 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTSKP43235 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTSKP43235 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTSKP43235 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTSKP43235 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTSKP43235 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTSKP43235 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSKP43235 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSKP43235 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSKP43235 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSKP43235 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSKP43235 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSKP43235 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSKP43235 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSKP43235 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTSKP43235 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTSKP43235 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTSKP43235 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTSKP43235 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSKP43235 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSKP43235 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSKP43235 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSKP43235 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSKP43235 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSKP43235 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSKP43235 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSKP43235 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSKP43235 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSKP43235 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSKP43235 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSKP43235 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSKP43235 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSKP43235 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTSKP43235 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CTSKP43235 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSKP43235 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSKP43235 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSKP43235 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSKP43235 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSKP43235 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSKP43235 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSKP43235 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTSKP43235 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTSKP43235 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTSKP43235 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTSKP43235 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTSKP43235 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTSKP43235 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTSKP43235 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTSKP43235 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTSKP43235 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTSKP43235 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTSKP43235 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTSKP43235 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSKP43235 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSKP43235 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSKP43235 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSKP43235 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSKP43235 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSKP43235 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSKP43235 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTSKP43235 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTSKP43235 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSKP43235 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSKP43235 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSKP43235 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSKP43235 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSKP43235 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSKP43235 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSKP43235 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSKP43235 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTSKP43235 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTSKP43235 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTSKP43235 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSKP43235 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSKP43235 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSKP43235 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSKP43235 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSKP43235 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSKP43235 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSKP43235 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSKP43235 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSKP43235 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms