Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CEACAM6P40199 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEACAM6P40199 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEACAM6P40199 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEACAM6P40199 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms