Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL3P39023 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL3P39023 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL3P39023 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL3P39023 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL3P39023 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL3P39023 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL3P39023 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3P39023 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3P39023 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3P39023 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3P39023 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3P39023 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3P39023 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3P39023 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3P39023 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3P39023 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3P39023 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL3P39023 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL3P39023 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL3P39023 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL3P39023 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL3P39023 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL3P39023 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL3P39023 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL3P39023 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL3P39023 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL3P39023 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL3P39023 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL3P39023 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL3P39023 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL3P39023 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL3P39023 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL3P39023 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL3P39023 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL3P39023 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL3P39023 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL3P39023 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL3P39023 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL3P39023 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL3P39023 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL3P39023 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL3P39023 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL3P39023 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL3P39023 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL3P39023 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL3P39023 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL3P39023 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL3P39023 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL3P39023 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL3P39023 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL3P39023 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL3P39023 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL3P39023 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL3P39023 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL3P39023 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL3P39023 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL3P39023 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL3P39023 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL3P39023 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL3P39023 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL3P39023 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL3P39023 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL3P39023 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL3P39023 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL3P39023 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL3P39023 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL3P39023 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL3P39023 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL3P39023 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL3P39023 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL3P39023 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL3P39023 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL3P39023 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL3P39023 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL3P39023 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL3P39023 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL3P39023 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL3P39023 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL3P39023 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL3P39023 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL3P39023 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL3P39023 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL3P39023 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL3P39023 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL3P39023 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL3P39023 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL3P39023 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL3P39023 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL3P39023 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL3P39023 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL3P39023 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL3P39023 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL3P39023 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL3P39023 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL3P39023 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL3P39023 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL3P39023 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL3P39023 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL3P39023 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms