Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPARGP37231 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARGP37231 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPARGP37231 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPARGP37231 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPARGP37231 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPARGP37231 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARGP37231 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARGP37231 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPARGP37231 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARGP37231 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARGP37231 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARGP37231 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARGP37231 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPARGP37231 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPARGP37231 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPARGP37231 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPARGP37231 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPARGP37231 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARGP37231 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARGP37231 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARGP37231 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARGP37231 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPARGP37231 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARGP37231 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPARGP37231 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PPARGP37231 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPARGP37231 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPARGP37231 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARGP37231 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPARGP37231 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPARGP37231 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPARGP37231 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPARGP37231 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPARGP37231 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPARGP37231 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARGP37231 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARGP37231 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARGP37231 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARGP37231 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARGP37231 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPARGP37231 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARGP37231 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARGP37231 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPARGP37231 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARGP37231 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARGP37231 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARGP37231 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPARGP37231 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPARGP37231 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPARGP37231 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPARGP37231 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPARGP37231 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPARGP37231 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPARGP37231 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPARGP37231 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPARGP37231 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPARGP37231 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPARGP37231 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARGP37231 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARGP37231 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARGP37231 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARGP37231 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARGP37231 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARGP37231 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARGP37231 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPARGP37231 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPARGP37231 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPARGP37231 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPARGP37231 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPARGP37231 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARGP37231 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARGP37231 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARGP37231 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPARGP37231 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPARGP37231 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPARGP37231 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPARGP37231 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPARGP37231 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPARGP37231 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPARGP37231 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARGP37231 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARGP37231 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPARGP37231 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARGP37231 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARGP37231 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPARGP37231 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARGP37231 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARGP37231 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARGP37231 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARGP37231 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARGP37231 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARGP37231 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPARGP37231 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPARGP37231 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPARGP37231 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPARGP37231 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPARGP37231 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARGP37231 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPARGP37231 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms