Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDIT3P35638 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
DDIT3P35638 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDIT3P35638 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDIT3P35638 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
DDIT3P35638 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDIT3P35638 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms