Protein–RNA interactions for Protein: P32971

TNFSF8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF8P32971 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF8P32971 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFSF8P32971 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF8P32971 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF8P32971 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms