Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXA11P31270 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA11P31270 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA11P31270 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA11P31270 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXA11P31270 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA11P31270 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA11P31270 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA11P31270 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXA11P31270 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA11P31270 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA11P31270 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA11P31270 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA11P31270 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXA11P31270 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXA11P31270 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA11P31270 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
HOXA11P31270 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HOXA11P31270 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXA11P31270 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms