Protein–RNA interactions for Protein: P30939

HTR1F, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1FP30939 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR1FP30939 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTR1FP30939 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1FP30939 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1FP30939 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTR1FP30939 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms