Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CNGA1P29973 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CNGA1P29973 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNGA1P29973 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNGA1P29973 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CNGA1P29973 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNGA1P29973 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms