Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EPHA2P29317 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EPHA2P29317 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA2P29317 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA2P29317 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA2P29317 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms