Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPL13P26373 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPL13P26373 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPL13P26373 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPL13P26373 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPL13P26373 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPL13P26373 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPL13P26373 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPL13P26373 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RPL13P26373 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RPL13P26373 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPL13P26373 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPL13P26373 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPL13P26373 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPL13P26373 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPL13P26373 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPL13P26373 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPL13P26373 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPL13P26373 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPL13P26373 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPL13P26373 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPL13P26373 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPL13P26373 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPL13P26373 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPL13P26373 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPL13P26373 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPL13P26373 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RPL13P26373 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPL13P26373 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPL13P26373 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPL13P26373 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPL13P26373 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPL13P26373 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPL13P26373 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPL13P26373 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPL13P26373 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPL13P26373 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPL13P26373 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPL13P26373 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPL13P26373 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RPL13P26373 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPL13P26373 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPL13P26373 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPL13P26373 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RPL13P26373 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPL13P26373 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPL13P26373 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPL13P26373 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPL13P26373 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPL13P26373 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPL13P26373 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPL13P26373 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPL13P26373 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPL13P26373 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPL13P26373 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPL13P26373 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPL13P26373 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPL13P26373 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPL13P26373 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPL13P26373 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPL13P26373 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RPL13P26373 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPL13P26373 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPL13P26373 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPL13P26373 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPL13P26373 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPL13P26373 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPL13P26373 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RPL13P26373 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPL13P26373 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPL13P26373 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RPL13P26373 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPL13P26373 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPL13P26373 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPL13P26373 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPL13P26373 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPL13P26373 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPL13P26373 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RPL13P26373 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPL13P26373 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPL13P26373 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPL13P26373 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPL13P26373 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPL13P26373 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPL13P26373 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL13P26373 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL13P26373 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL13P26373 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPL13P26373 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPL13P26373 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPL13P26373 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPL13P26373 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPL13P26373 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPL13P26373 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPL13P26373 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPL13P26373 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPL13P26373 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPL13P26373 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPL13P26373 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPL13P26373 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms