Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO1P25800 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO1P25800 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO1P25800 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LMO1P25800 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO1P25800 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LMO1P25800 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO1P25800 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO1P25800 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO1P25800 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LMO1P25800 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO1P25800 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO1P25800 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO1P25800 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO1P25800 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
LMO1P25800 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO1P25800 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO1P25800 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO1P25800 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO1P25800 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO1P25800 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO1P25800 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO1P25800 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO1P25800 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO1P25800 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO1P25800 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO1P25800 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO1P25800 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO1P25800 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO1P25800 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO1P25800 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO1P25800 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO1P25800 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO1P25800 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO1P25800 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO1P25800 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO1P25800 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO1P25800 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO1P25800 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO1P25800 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO1P25800 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO1P25800 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO1P25800 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO1P25800 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO1P25800 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO1P25800 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO1P25800 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO1P25800 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO1P25800 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO1P25800 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO1P25800 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO1P25800 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO1P25800 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO1P25800 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO1P25800 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO1P25800 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO1P25800 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO1P25800 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO1P25800 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO1P25800 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO1P25800 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO1P25800 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO1P25800 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO1P25800 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO1P25800 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO1P25800 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO1P25800 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO1P25800 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO1P25800 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO1P25800 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO1P25800 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO1P25800 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO1P25800 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO1P25800 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO1P25800 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO1P25800 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO1P25800 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO1P25800 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO1P25800 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO1P25800 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO1P25800 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO1P25800 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO1P25800 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO1P25800 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO1P25800 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO1P25800 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO1P25800 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO1P25800 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO1P25800 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO1P25800 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO1P25800 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LMO1P25800 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO1P25800 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO1P25800 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO1P25800 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO1P25800 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO1P25800 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO1P25800 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO1P25800 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMO1P25800 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms