Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSR1P21757 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSR1P21757 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSR1P21757 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSR1P21757 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSR1P21757 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSR1P21757 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSR1P21757 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSR1P21757 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSR1P21757 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSR1P21757 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSR1P21757 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSR1P21757 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSR1P21757 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MSR1P21757 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MSR1P21757 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSR1P21757 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSR1P21757 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MSR1P21757 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSR1P21757 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MSR1P21757 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSR1P21757 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSR1P21757 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSR1P21757 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSR1P21757 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSR1P21757 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSR1P21757 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSR1P21757 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MSR1P21757 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSR1P21757 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSR1P21757 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSR1P21757 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSR1P21757 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSR1P21757 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSR1P21757 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MSR1P21757 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSR1P21757 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSR1P21757 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSR1P21757 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSR1P21757 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSR1P21757 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSR1P21757 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MSR1P21757 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSR1P21757 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MSR1P21757 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MSR1P21757 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MSR1P21757 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MSR1P21757 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSR1P21757 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSR1P21757 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSR1P21757 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MSR1P21757 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSR1P21757 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSR1P21757 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSR1P21757 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MSR1P21757 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSR1P21757 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSR1P21757 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSR1P21757 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSR1P21757 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MSR1P21757 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSR1P21757 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSR1P21757 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSR1P21757 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSR1P21757 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSR1P21757 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSR1P21757 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSR1P21757 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MSR1P21757 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSR1P21757 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSR1P21757 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSR1P21757 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MSR1P21757 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSR1P21757 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSR1P21757 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MSR1P21757 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSR1P21757 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSR1P21757 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MSR1P21757 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MSR1P21757 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MSR1P21757 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MSR1P21757 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MSR1P21757 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSR1P21757 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSR1P21757 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSR1P21757 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSR1P21757 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSR1P21757 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSR1P21757 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MSR1P21757 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSR1P21757 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSR1P21757 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MSR1P21757 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSR1P21757 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSR1P21757 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSR1P21757 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MSR1P21757 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MSR1P21757 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSR1P21757 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSR1P21757 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms