Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA5P20719 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXA5P20719 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXA5P20719 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXA5P20719 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms