Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNA2P20248 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNA2P20248 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCNA2P20248 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA2P20248 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms