Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRMP19623 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRMP19623 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRMP19623 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRMP19623 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRMP19623 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRMP19623 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRMP19623 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRMP19623 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRMP19623 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRMP19623 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRMP19623 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRMP19623 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRMP19623 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRMP19623 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRMP19623 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRMP19623 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRMP19623 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRMP19623 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRMP19623 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRMP19623 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRMP19623 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRMP19623 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRMP19623 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRMP19623 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRMP19623 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRMP19623 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRMP19623 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRMP19623 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRMP19623 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRMP19623 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRMP19623 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRMP19623 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRMP19623 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRMP19623 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRMP19623 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRMP19623 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRMP19623 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRMP19623 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRMP19623 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRMP19623 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRMP19623 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRMP19623 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SRMP19623 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRMP19623 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRMP19623 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRMP19623 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRMP19623 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRMP19623 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRMP19623 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRMP19623 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRMP19623 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRMP19623 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRMP19623 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRMP19623 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRMP19623 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRMP19623 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRMP19623 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRMP19623 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRMP19623 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRMP19623 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRMP19623 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRMP19623 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRMP19623 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRMP19623 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRMP19623 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRMP19623 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRMP19623 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRMP19623 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRMP19623 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRMP19623 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRMP19623 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SRMP19623 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRMP19623 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRMP19623 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRMP19623 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRMP19623 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRMP19623 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRMP19623 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRMP19623 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRMP19623 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRMP19623 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRMP19623 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRMP19623 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRMP19623 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRMP19623 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRMP19623 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRMP19623 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRMP19623 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRMP19623 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRMP19623 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRMP19623 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRMP19623 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRMP19623 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRMP19623 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRMP19623 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRMP19623 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRMP19623 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRMP19623 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRMP19623 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms