Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFEBP19484 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFEBP19484 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFEBP19484 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFEBP19484 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFEBP19484 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFEBP19484 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFEBP19484 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFEBP19484 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFEBP19484 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFEBP19484 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFEBP19484 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFEBP19484 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFEBP19484 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFEBP19484 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFEBP19484 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFEBP19484 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFEBP19484 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFEBP19484 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFEBP19484 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFEBP19484 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFEBP19484 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFEBP19484 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFEBP19484 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFEBP19484 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFEBP19484 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFEBP19484 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFEBP19484 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFEBP19484 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFEBP19484 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFEBP19484 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFEBP19484 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFEBP19484 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFEBP19484 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFEBP19484 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFEBP19484 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFEBP19484 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFEBP19484 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFEBP19484 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFEBP19484 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFEBP19484 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFEBP19484 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TFEBP19484 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFEBP19484 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFEBP19484 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFEBP19484 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFEBP19484 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFEBP19484 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFEBP19484 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFEBP19484 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFEBP19484 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFEBP19484 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFEBP19484 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFEBP19484 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFEBP19484 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFEBP19484 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFEBP19484 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFEBP19484 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFEBP19484 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFEBP19484 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFEBP19484 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TFEBP19484 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFEBP19484 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFEBP19484 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TFEBP19484 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFEBP19484 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFEBP19484 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFEBP19484 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFEBP19484 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFEBP19484 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TFEBP19484 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFEBP19484 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFEBP19484 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFEBP19484 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFEBP19484 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFEBP19484 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFEBP19484 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFEBP19484 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFEBP19484 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFEBP19484 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFEBP19484 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFEBP19484 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFEBP19484 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFEBP19484 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TFEBP19484 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFEBP19484 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFEBP19484 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFEBP19484 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFEBP19484 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFEBP19484 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFEBP19484 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFEBP19484 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFEBP19484 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFEBP19484 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFEBP19484 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFEBP19484 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFEBP19484 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFEBP19484 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFEBP19484 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TFEBP19484 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms