Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCC1P18754 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCC1P18754 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCC1P18754 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCC1P18754 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCC1P18754 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCC1P18754 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RCC1P18754 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCC1P18754 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCC1P18754 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCC1P18754 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCC1P18754 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCC1P18754 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCC1P18754 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCC1P18754 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCC1P18754 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCC1P18754 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC1P18754 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC1P18754 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC1P18754 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC1P18754 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC1P18754 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC1P18754 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC1P18754 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC1P18754 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC1P18754 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC1P18754 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC1P18754 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCC1P18754 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCC1P18754 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCC1P18754 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCC1P18754 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCC1P18754 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCC1P18754 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCC1P18754 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCC1P18754 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCC1P18754 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCC1P18754 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCC1P18754 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCC1P18754 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCC1P18754 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCC1P18754 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCC1P18754 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCC1P18754 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCC1P18754 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RCC1P18754 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCC1P18754 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCC1P18754 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RCC1P18754 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC1P18754 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC1P18754 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC1P18754 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC1P18754 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC1P18754 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC1P18754 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC1P18754 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC1P18754 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC1P18754 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC1P18754 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC1P18754 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RCC1P18754 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCC1P18754 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCC1P18754 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RCC1P18754 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RCC1P18754 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RCC1P18754 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCC1P18754 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCC1P18754 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCC1P18754 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RCC1P18754 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCC1P18754 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCC1P18754 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCC1P18754 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCC1P18754 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCC1P18754 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCC1P18754 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RCC1P18754 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RCC1P18754 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCC1P18754 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RCC1P18754 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC1P18754 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC1P18754 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC1P18754 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC1P18754 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC1P18754 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC1P18754 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCC1P18754 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCC1P18754 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCC1P18754 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCC1P18754 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCC1P18754 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCC1P18754 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCC1P18754 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCC1P18754 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCC1P18754 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCC1P18754 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCC1P18754 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCC1P18754 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCC1P18754 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCC1P18754 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms