Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EGR1P18146 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EGR1P18146 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EGR1P18146 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EGR1P18146 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EGR1P18146 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR1P18146 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR1P18146 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EGR1P18146 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR1P18146 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR1P18146 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR1P18146 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR1P18146 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR1P18146 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EGR1P18146 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR1P18146 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR1P18146 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR1P18146 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR1P18146 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR1P18146 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR1P18146 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR1P18146 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EGR1P18146 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR1P18146 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EGR1P18146 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR1P18146 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR1P18146 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR1P18146 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR1P18146 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EGR1P18146 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EGR1P18146 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EGR1P18146 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EGR1P18146 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGR1P18146 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGR1P18146 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGR1P18146 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGR1P18146 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EGR1P18146 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR1P18146 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR1P18146 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR1P18146 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EGR1P18146 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR1P18146 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR1P18146 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR1P18146 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EGR1P18146 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGR1P18146 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGR1P18146 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGR1P18146 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EGR1P18146 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR1P18146 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR1P18146 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR1P18146 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR1P18146 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR1P18146 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR1P18146 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EGR1P18146 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EGR1P18146 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGR1P18146 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EGR1P18146 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGR1P18146 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGR1P18146 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGR1P18146 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGR1P18146 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EGR1P18146 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EGR1P18146 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGR1P18146 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EGR1P18146 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR1P18146 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR1P18146 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR1P18146 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR1P18146 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR1P18146 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR1P18146 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EGR1P18146 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EGR1P18146 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EGR1P18146 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EGR1P18146 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EGR1P18146 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EGR1P18146 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EGR1P18146 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EGR1P18146 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EGR1P18146 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EGR1P18146 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EGR1P18146 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EGR1P18146 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EGR1P18146 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EGR1P18146 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EGR1P18146 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EGR1P18146 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EGR1P18146 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EGR1P18146 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EGR1P18146 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR1P18146 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR1P18146 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR1P18146 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR1P18146 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EGR1P18146 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EGR1P18146 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EGR1P18146 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms