Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXB8P17481 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXB8P17481 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXB8P17481 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXB8P17481 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXB8P17481 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXB8P17481 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms