Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGB4P16144 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGB4P16144 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ITGB4P16144 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ITGB4P16144 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ITGB4P16144 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ITGB4P16144 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ITGB4P16144 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGB4P16144 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGB4P16144 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGB4P16144 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ITGB4P16144 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITGB4P16144 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITGB4P16144 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITGB4P16144 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 787.8 ms