Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD44P16070 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD44P16070 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD44P16070 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD44P16070 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD44P16070 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CD44P16070 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CD44P16070 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CD44P16070 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CD44P16070 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD44P16070 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CD44P16070 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD44P16070 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CD44P16070 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD44P16070 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD44P16070 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD44P16070 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD44P16070 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CD44P16070 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CD44P16070 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD44P16070 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD44P16070 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD44P16070 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD44P16070 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD44P16070 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD44P16070 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD44P16070 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CD44P16070 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD44P16070 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD44P16070 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD44P16070 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD44P16070 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD44P16070 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CD44P16070 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CD44P16070 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CD44P16070 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CD44P16070 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD44P16070 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD44P16070 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CD44P16070 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD44P16070 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD44P16070 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD44P16070 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD44P16070 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD44P16070 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CD44P16070 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CD44P16070 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD44P16070 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD44P16070 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CD44P16070 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD44P16070 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD44P16070 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CD44P16070 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD44P16070 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD44P16070 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD44P16070 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CD44P16070 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD44P16070 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD44P16070 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CD44P16070 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CD44P16070 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CD44P16070 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD44P16070 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD44P16070 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CD44P16070 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CD44P16070 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD44P16070 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD44P16070 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD44P16070 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD44P16070 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD44P16070 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD44P16070 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD44P16070 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD44P16070 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD44P16070 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD44P16070 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD44P16070 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD44P16070 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD44P16070 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD44P16070 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD44P16070 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD44P16070 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD44P16070 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD44P16070 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD44P16070 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CD44P16070 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CD44P16070 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD44P16070 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD44P16070 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CD44P16070 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD44P16070 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD44P16070 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CD44P16070 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CD44P16070 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD44P16070 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD44P16070 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD44P16070 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD44P16070 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD44P16070 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CD44P16070 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms