Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA2P15927 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA2P15927 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA2P15927 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA2P15927 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA2P15927 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA2P15927 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA2P15927 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA2P15927 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA2P15927 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA2P15927 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA2P15927 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA2P15927 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA2P15927 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA2P15927 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA2P15927 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA2P15927 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA2P15927 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA2P15927 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA2P15927 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA2P15927 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA2P15927 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA2P15927 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA2P15927 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA2P15927 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA2P15927 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA2P15927 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA2P15927 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA2P15927 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA2P15927 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA2P15927 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA2P15927 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPA2P15927 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPA2P15927 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA2P15927 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA2P15927 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPA2P15927 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA2P15927 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA2P15927 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA2P15927 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA2P15927 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPA2P15927 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA2P15927 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA2P15927 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA2P15927 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA2P15927 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA2P15927 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPA2P15927 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA2P15927 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPA2P15927 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPA2P15927 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPA2P15927 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPA2P15927 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPA2P15927 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPA2P15927 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPA2P15927 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPA2P15927 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPA2P15927 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPA2P15927 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPA2P15927 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPA2P15927 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPA2P15927 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPA2P15927 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPA2P15927 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPA2P15927 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPA2P15927 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPA2P15927 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPA2P15927 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPA2P15927 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPA2P15927 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPA2P15927 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPA2P15927 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPA2P15927 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPA2P15927 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPA2P15927 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPA2P15927 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPA2P15927 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPA2P15927 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPA2P15927 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPA2P15927 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPA2P15927 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPA2P15927 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPA2P15927 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA2P15927 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA2P15927 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA2P15927 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA2P15927 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA2P15927 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA2P15927 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA2P15927 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA2P15927 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA2P15927 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA2P15927 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA2P15927 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA2P15927 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA2P15927 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA2P15927 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA2P15927 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA2P15927 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA2P15927 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms