Protein–RNA interactions for Protein: P15086

CPB1, Carboxypeptidase B, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPB1P15086 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPB1P15086 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPB1P15086 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPB1P15086 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPB1P15086 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPB1P15086 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPB1P15086 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPB1P15086 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPB1P15086 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPB1P15086 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPB1P15086 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPB1P15086 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPB1P15086 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPB1P15086 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPB1P15086 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPB1P15086 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPB1P15086 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPB1P15086 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPB1P15086 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPB1P15086 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPB1P15086 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPB1P15086 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPB1P15086 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CPB1P15086 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPB1P15086 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPB1P15086 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPB1P15086 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPB1P15086 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPB1P15086 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPB1P15086 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPB1P15086 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPB1P15086 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CPB1P15086 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPB1P15086 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPB1P15086 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPB1P15086 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPB1P15086 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPB1P15086 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPB1P15086 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPB1P15086 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPB1P15086 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPB1P15086 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPB1P15086 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPB1P15086 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPB1P15086 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPB1P15086 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPB1P15086 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CPB1P15086 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPB1P15086 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPB1P15086 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPB1P15086 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPB1P15086 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPB1P15086 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPB1P15086 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPB1P15086 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPB1P15086 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPB1P15086 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPB1P15086 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CPB1P15086 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPB1P15086 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPB1P15086 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CPB1P15086 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPB1P15086 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPB1P15086 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPB1P15086 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPB1P15086 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPB1P15086 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPB1P15086 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPB1P15086 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPB1P15086 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPB1P15086 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CPB1P15086 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPB1P15086 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPB1P15086 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPB1P15086 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPB1P15086 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPB1P15086 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPB1P15086 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPB1P15086 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPB1P15086 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPB1P15086 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPB1P15086 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPB1P15086 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPB1P15086 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPB1P15086 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPB1P15086 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPB1P15086 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPB1P15086 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPB1P15086 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPB1P15086 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPB1P15086 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPB1P15086 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPB1P15086 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPB1P15086 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPB1P15086 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPB1P15086 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPB1P15086 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPB1P15086 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPB1P15086 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPB1P15086 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms