Protein–RNA interactions for Protein: P13196

ALAS1, 5-aminolevulinate synthase, nonspecific, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALAS1P13196 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALAS1P13196 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALAS1P13196 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALAS1P13196 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALAS1P13196 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALAS1P13196 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALAS1P13196 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALAS1P13196 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALAS1P13196 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALAS1P13196 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALAS1P13196 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALAS1P13196 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALAS1P13196 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALAS1P13196 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms