Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NR2C1P13056 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2C1P13056 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR2C1P13056 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2C1P13056 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms