Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41P11171 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
EPB41P11171 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41P11171 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41P11171 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41P11171 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41P11171 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41P11171 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41P11171 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41P11171 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41P11171 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41P11171 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41P11171 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41P11171 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41P11171 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41P11171 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41P11171 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41P11171 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41P11171 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41P11171 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41P11171 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41P11171 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41P11171 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41P11171 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41P11171 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41P11171 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41P11171 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41P11171 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41P11171 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41P11171 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41P11171 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41P11171 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41P11171 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41P11171 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41P11171 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41P11171 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41P11171 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41P11171 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41P11171 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41P11171 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41P11171 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41P11171 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41P11171 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41P11171 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41P11171 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41P11171 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41P11171 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41P11171 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41P11171 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPB41P11171 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPB41P11171 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPB41P11171 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPB41P11171 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41P11171 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41P11171 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41P11171 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41P11171 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41P11171 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41P11171 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41P11171 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPB41P11171 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPB41P11171 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPB41P11171 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EPB41P11171 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPB41P11171 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPB41P11171 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPB41P11171 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPB41P11171 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPB41P11171 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPB41P11171 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPB41P11171 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPB41P11171 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPB41P11171 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPB41P11171 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPB41P11171 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPB41P11171 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
EPB41P11171 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EPB41P11171 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPB41P11171 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPB41P11171 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41P11171 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41P11171 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41P11171 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41P11171 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPB41P11171 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPB41P11171 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41P11171 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41P11171 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41P11171 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41P11171 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPB41P11171 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41P11171 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41P11171 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41P11171 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPB41P11171 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPB41P11171 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPB41P11171 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPB41P11171 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPB41P11171 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
EPB41P11171 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms