Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARBP10826 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RARBP10826 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RARBP10826 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARBP10826 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARBP10826 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARBP10826 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARBP10826 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARBP10826 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARBP10826 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARBP10826 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARBP10826 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RARBP10826 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARBP10826 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARBP10826 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARBP10826 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARBP10826 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARBP10826 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RARBP10826 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RARBP10826 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARBP10826 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RARBP10826 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RARBP10826 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RARBP10826 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RARBP10826 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RARBP10826 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RARBP10826 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RARBP10826 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RARBP10826 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RARBP10826 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RARBP10826 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RARBP10826 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RARBP10826 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RARBP10826 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RARBP10826 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RARBP10826 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RARBP10826 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RARBP10826 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RARBP10826 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RARBP10826 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RARBP10826 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RARBP10826 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RARBP10826 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RARBP10826 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARBP10826 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARBP10826 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARBP10826 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RARBP10826 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RARBP10826 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RARBP10826 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RARBP10826 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RARBP10826 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARBP10826 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RARBP10826 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARBP10826 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARBP10826 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARBP10826 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RARBP10826 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARBP10826 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARBP10826 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RARBP10826 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RARBP10826 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARBP10826 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARBP10826 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARBP10826 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RARBP10826 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RARBP10826 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RARBP10826 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RARBP10826 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RARBP10826 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RARBP10826 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RARBP10826 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RARBP10826 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RARBP10826 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARBP10826 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARBP10826 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARBP10826 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARBP10826 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RARBP10826 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RARBP10826 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RARBP10826 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RARBP10826 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RARBP10826 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RARBP10826 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RARBP10826 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RARBP10826 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RARBP10826 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RARBP10826 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RARBP10826 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RARBP10826 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RARBP10826 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RARBP10826 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RARBP10826 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RARBP10826 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RARBP10826 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RARBP10826 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RARBP10826 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RARBP10826 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RARBP10826 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RARBP10826 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms