Protein–RNA interactions for Protein: P0DP71

FAM236C, Protein FAM236C, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM236CP0DP71 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM236CP0DP71 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM236CP0DP71 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM236CP0DP71 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM236CP0DP71 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms