Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM225BP0DP42 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM225BP0DP42 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM225BP0DP42 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM225BP0DP42 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms