Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CSH2P0DML3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CSH2P0DML3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CSH2P0DML3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CSH2P0DML3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms