Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMIM18P0DKX4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMIM18P0DKX4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMIM18P0DKX4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMIM18P0DKX4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMIM18P0DKX4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms