Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXC6P09630 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXC6P09630 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXC6P09630 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXC6P09630 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXC6P09630 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXC6P09630 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXC6P09630 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXC6P09630 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXC6P09630 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC6P09630 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXC6P09630 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.9 ms