Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CD74P04233 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD74P04233 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD74P04233 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD74P04233 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD74P04233 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD74P04233 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD74P04233 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD74P04233 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CD74P04233 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CD74P04233 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD74P04233 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD74P04233 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD74P04233 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CD74P04233 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CD74P04233 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD74P04233 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD74P04233 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CD74P04233 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD74P04233 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD74P04233 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD74P04233 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD74P04233 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CD74P04233 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD74P04233 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD74P04233 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CD74P04233 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CD74P04233 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD74P04233 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD74P04233 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD74P04233 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD74P04233 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD74P04233 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD74P04233 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CD74P04233 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD74P04233 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD74P04233 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD74P04233 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CD74P04233 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD74P04233 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CD74P04233 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD74P04233 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CD74P04233 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD74P04233 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD74P04233 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD74P04233 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD74P04233 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD74P04233 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD74P04233 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD74P04233 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD74P04233 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD74P04233 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD74P04233 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD74P04233 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD74P04233 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD74P04233 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD74P04233 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD74P04233 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD74P04233 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD74P04233 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD74P04233 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD74P04233 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD74P04233 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD74P04233 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD74P04233 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD74P04233 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD74P04233 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD74P04233 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD74P04233 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD74P04233 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD74P04233 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD74P04233 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD74P04233 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD74P04233 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD74P04233 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD74P04233 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD74P04233 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD74P04233 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD74P04233 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD74P04233 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD74P04233 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD74P04233 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD74P04233 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD74P04233 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD74P04233 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD74P04233 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD74P04233 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD74P04233 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD74P04233 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD74P04233 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD74P04233 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD74P04233 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD74P04233 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CD74P04233 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD74P04233 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD74P04233 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD74P04233 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD74P04233 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD74P04233 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD74P04233 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms