Protein–RNA interactions for Protein: P04155

TFF1, Trefoil factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF1P04155 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFF1P04155 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFF1P04155 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFF1P04155 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFF1P04155 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFF1P04155 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFF1P04155 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFF1P04155 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFF1P04155 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFF1P04155 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFF1P04155 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFF1P04155 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TFF1P04155 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TFF1P04155 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFF1P04155 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFF1P04155 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFF1P04155 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFF1P04155 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF1P04155 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF1P04155 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF1P04155 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF1P04155 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFF1P04155 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF1P04155 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF1P04155 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF1P04155 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF1P04155 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF1P04155 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF1P04155 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF1P04155 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFF1P04155 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFF1P04155 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFF1P04155 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFF1P04155 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFF1P04155 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFF1P04155 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFF1P04155 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFF1P04155 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFF1P04155 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFF1P04155 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFF1P04155 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF1P04155 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF1P04155 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF1P04155 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF1P04155 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF1P04155 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFF1P04155 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFF1P04155 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TFF1P04155 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFF1P04155 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFF1P04155 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF1P04155 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF1P04155 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF1P04155 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF1P04155 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF1P04155 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF1P04155 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFF1P04155 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFF1P04155 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TFF1P04155 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TFF1P04155 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFF1P04155 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TFF1P04155 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFF1P04155 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFF1P04155 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFF1P04155 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFF1P04155 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TFF1P04155 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFF1P04155 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFF1P04155 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TFF1P04155 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFF1P04155 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TFF1P04155 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFF1P04155 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF1P04155 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF1P04155 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF1P04155 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF1P04155 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF1P04155 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF1P04155 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF1P04155 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF1P04155 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF1P04155 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFF1P04155 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF1P04155 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFF1P04155 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFF1P04155 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFF1P04155 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFF1P04155 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFF1P04155 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFF1P04155 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFF1P04155 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF1P04155 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF1P04155 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF1P04155 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF1P04155 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF1P04155 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF1P04155 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFF1P04155 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TFF1P04155 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms