Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MT-ND1P03886 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MT-ND1P03886 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MT-ND1P03886 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MT-ND1P03886 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms