Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CST1P01037 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CST1P01037 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CST1P01037 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CST1P01037 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CST1P01037 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CST1P01037 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CST1P01037 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CST1P01037 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CST1P01037 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CST1P01037 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CST1P01037 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CST1P01037 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CST1P01037 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CST1P01037 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CST1P01037 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CST1P01037 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CST1P01037 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CST1P01037 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CST1P01037 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CST1P01037 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CST1P01037 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CST1P01037 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CST1P01037 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CST1P01037 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CST1P01037 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CST1P01037 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CST1P01037 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CST1P01037 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CST1P01037 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CST1P01037 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CST1P01037 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CST1P01037 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CST1P01037 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CST1P01037 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CST1P01037 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CST1P01037 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CST1P01037 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CST1P01037 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CST1P01037 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CST1P01037 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CST1P01037 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CST1P01037 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CST1P01037 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CST1P01037 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CST1P01037 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CST1P01037 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CST1P01037 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CST1P01037 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CST1P01037 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CST1P01037 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CST1P01037 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CST1P01037 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CST1P01037 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CST1P01037 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CST1P01037 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CST1P01037 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CST1P01037 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CST1P01037 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CST1P01037 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CST1P01037 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CST1P01037 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CST1P01037 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CST1P01037 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CST1P01037 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CST1P01037 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CST1P01037 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CST1P01037 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CST1P01037 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CST1P01037 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CST1P01037 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CST1P01037 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CST1P01037 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CST1P01037 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CST1P01037 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CST1P01037 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CST1P01037 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CST1P01037 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CST1P01037 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CST1P01037 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CST1P01037 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CST1P01037 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CST1P01037 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CST1P01037 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CST1P01037 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CST1P01037 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CST1P01037 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CST1P01037 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CST1P01037 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CST1P01037 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CST1P01037 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CST1P01037 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CST1P01037 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CST1P01037 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CST1P01037 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CST1P01037 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CST1P01037 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CST1P01037 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CST1P01037 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CST1P01037 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms