Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTCP00480 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTCP00480 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTCP00480 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTCP00480 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTCP00480 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTCP00480 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTCP00480 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTCP00480 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTCP00480 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTCP00480 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTCP00480 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTCP00480 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTCP00480 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTCP00480 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTCP00480 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTCP00480 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTCP00480 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
OTCP00480 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTCP00480 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTCP00480 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTCP00480 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTCP00480 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OTCP00480 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTCP00480 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTCP00480 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTCP00480 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTCP00480 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTCP00480 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
OTCP00480 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTCP00480 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTCP00480 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OTCP00480 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTCP00480 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTCP00480 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTCP00480 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
OTCP00480 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTCP00480 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTCP00480 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTCP00480 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTCP00480 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTCP00480 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTCP00480 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTCP00480 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTCP00480 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTCP00480 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTCP00480 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTCP00480 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTCP00480 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTCP00480 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTCP00480 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
OTCP00480 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTCP00480 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTCP00480 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
OTCP00480 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
OTCP00480 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTCP00480 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTCP00480 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTCP00480 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTCP00480 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTCP00480 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTCP00480 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OTCP00480 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTCP00480 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTCP00480 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTCP00480 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTCP00480 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTCP00480 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTCP00480 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTCP00480 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTCP00480 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTCP00480 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTCP00480 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTCP00480 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTCP00480 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTCP00480 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
OTCP00480 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTCP00480 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTCP00480 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTCP00480 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTCP00480 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTCP00480 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
OTCP00480 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
OTCP00480 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTCP00480 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTCP00480 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTCP00480 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTCP00480 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTCP00480 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTCP00480 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
OTCP00480 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTCP00480 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTCP00480 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTCP00480 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OTCP00480 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTCP00480 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
OTCP00480 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTCP00480 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTCP00480 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTCP00480 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms