Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLIC3O95833 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLIC3O95833 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLIC3O95833 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLIC3O95833 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLIC3O95833 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLIC3O95833 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.9 ms