Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIX3O95343 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX3O95343 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX3O95343 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX3O95343 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX3O95343 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX3O95343 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIX3O95343 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIX3O95343 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIX3O95343 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIX3O95343 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX3O95343 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX3O95343 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIX3O95343 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX3O95343 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX3O95343 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX3O95343 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX3O95343 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX3O95343 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX3O95343 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX3O95343 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIX3O95343 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX3O95343 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIX3O95343 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX3O95343 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX3O95343 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX3O95343 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SIX3O95343 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX3O95343 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX3O95343 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIX3O95343 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIX3O95343 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIX3O95343 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX3O95343 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIX3O95343 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX3O95343 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX3O95343 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX3O95343 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIX3O95343 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX3O95343 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX3O95343 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX3O95343 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX3O95343 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIX3O95343 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX3O95343 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX3O95343 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIX3O95343 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX3O95343 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIX3O95343 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX3O95343 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX3O95343 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX3O95343 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX3O95343 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIX3O95343 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX3O95343 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX3O95343 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX3O95343 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX3O95343 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX3O95343 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX3O95343 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX3O95343 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX3O95343 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX3O95343 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX3O95343 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX3O95343 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX3O95343 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX3O95343 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX3O95343 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX3O95343 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX3O95343 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX3O95343 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX3O95343 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX3O95343 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX3O95343 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX3O95343 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX3O95343 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX3O95343 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX3O95343 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX3O95343 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX3O95343 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX3O95343 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX3O95343 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX3O95343 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX3O95343 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX3O95343 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX3O95343 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX3O95343 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX3O95343 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX3O95343 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX3O95343 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX3O95343 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX3O95343 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX3O95343 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX3O95343 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX3O95343 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX3O95343 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX3O95343 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX3O95343 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX3O95343 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX3O95343 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms