Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC44.02■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
SOGA1O94964 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
SOGA1O94964 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
SOGA1O94964 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
SOGA1O94964 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
SOGA1O94964 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
SOGA1O94964 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
SOGA1O94964 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
SOGA1O94964 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.98■■■■■ 4.63
SOGA1O94964 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
SOGA1O94964 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
SOGA1O94964 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
SOGA1O94964 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
SOGA1O94964 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
SOGA1O94964 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
SOGA1O94964 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
SOGA1O94964 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
SOGA1O94964 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
SOGA1O94964 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
SOGA1O94964 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
SOGA1O94964 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
SOGA1O94964 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
SOGA1O94964 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.6
SOGA1O94964 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
SOGA1O94964 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
SOGA1O94964 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
SOGA1O94964 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
SOGA1O94964 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
SOGA1O94964 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
SOGA1O94964 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
SOGA1O94964 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
SOGA1O94964 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC43.77■■■■■ 4.6
SOGA1O94964 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
SOGA1O94964 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
SOGA1O94964 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC43.7■■■■■ 4.59
SOGA1O94964 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
SOGA1O94964 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
SOGA1O94964 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
SOGA1O94964 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SOGA1O94964 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SOGA1O94964 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SOGA1O94964 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
SOGA1O94964 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
SOGA1O94964 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
SOGA1O94964 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC43.65■■■■■ 4.58
SOGA1O94964 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
SOGA1O94964 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
SOGA1O94964 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
SOGA1O94964 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
SOGA1O94964 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
SOGA1O94964 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
SOGA1O94964 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
SOGA1O94964 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
SOGA1O94964 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
SOGA1O94964 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
SOGA1O94964 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
SOGA1O94964 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
SOGA1O94964 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
SOGA1O94964 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.57■■■■■ 4.56
SOGA1O94964 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.56■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms