Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPXO76031 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPXO76031 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPXO76031 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPXO76031 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPXO76031 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPXO76031 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPXO76031 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLPXO76031 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPXO76031 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPXO76031 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPXO76031 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPXO76031 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPXO76031 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPXO76031 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPXO76031 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLPXO76031 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPXO76031 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPXO76031 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLPXO76031 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPXO76031 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPXO76031 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPXO76031 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLPXO76031 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPXO76031 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLPXO76031 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPXO76031 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPXO76031 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPXO76031 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPXO76031 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPXO76031 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLPXO76031 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLPXO76031 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPXO76031 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPXO76031 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLPXO76031 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPXO76031 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLPXO76031 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPXO76031 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLPXO76031 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPXO76031 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPXO76031 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPXO76031 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLPXO76031 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPXO76031 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPXO76031 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLPXO76031 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPXO76031 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLPXO76031 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPXO76031 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPXO76031 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPXO76031 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPXO76031 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPXO76031 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPXO76031 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPXO76031 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLPXO76031 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLPXO76031 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPXO76031 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLPXO76031 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLPXO76031 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLPXO76031 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPXO76031 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPXO76031 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPXO76031 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPXO76031 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLPXO76031 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPXO76031 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPXO76031 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPXO76031 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLPXO76031 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPXO76031 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLPXO76031 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLPXO76031 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLPXO76031 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPXO76031 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPXO76031 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPXO76031 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPXO76031 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPXO76031 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPXO76031 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPXO76031 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPXO76031 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPXO76031 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPXO76031 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPXO76031 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPXO76031 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPXO76031 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPXO76031 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPXO76031 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPXO76031 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPXO76031 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPXO76031 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPXO76031 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPXO76031 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPXO76031 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPXO76031 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPXO76031 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPXO76031 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPXO76031 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms