Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRCPO75575 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRCPO75575 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRCPO75575 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRCPO75575 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRCPO75575 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRCPO75575 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRCPO75575 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRCPO75575 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRCPO75575 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRCPO75575 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRCPO75575 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRCPO75575 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRCPO75575 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRCPO75575 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRCPO75575 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRCPO75575 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRCPO75575 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRCPO75575 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRCPO75575 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRCPO75575 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRCPO75575 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRCPO75575 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRCPO75575 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRCPO75575 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRCPO75575 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRCPO75575 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRCPO75575 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRCPO75575 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRCPO75575 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRCPO75575 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRCPO75575 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRCPO75575 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRCPO75575 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRCPO75575 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRCPO75575 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRCPO75575 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRCPO75575 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRCPO75575 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRCPO75575 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRCPO75575 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CRCPO75575 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRCPO75575 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRCPO75575 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRCPO75575 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRCPO75575 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRCPO75575 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRCPO75575 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRCPO75575 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRCPO75575 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRCPO75575 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRCPO75575 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRCPO75575 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRCPO75575 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRCPO75575 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRCPO75575 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CRCPO75575 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRCPO75575 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRCPO75575 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRCPO75575 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRCPO75575 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRCPO75575 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRCPO75575 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRCPO75575 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRCPO75575 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRCPO75575 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRCPO75575 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRCPO75575 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CRCPO75575 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRCPO75575 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRCPO75575 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRCPO75575 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRCPO75575 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRCPO75575 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRCPO75575 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRCPO75575 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRCPO75575 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRCPO75575 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRCPO75575 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRCPO75575 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRCPO75575 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRCPO75575 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRCPO75575 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRCPO75575 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRCPO75575 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRCPO75575 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRCPO75575 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRCPO75575 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRCPO75575 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRCPO75575 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRCPO75575 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRCPO75575 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRCPO75575 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRCPO75575 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRCPO75575 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRCPO75575 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRCPO75575 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRCPO75575 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRCPO75575 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRCPO75575 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms