Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN5O75503 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN5O75503 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLN5O75503 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN5O75503 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN5O75503 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN5O75503 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN5O75503 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN5O75503 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN5O75503 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN5O75503 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN5O75503 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN5O75503 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN5O75503 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN5O75503 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLN5O75503 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN5O75503 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN5O75503 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN5O75503 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN5O75503 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLN5O75503 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN5O75503 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN5O75503 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN5O75503 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN5O75503 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLN5O75503 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN5O75503 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN5O75503 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN5O75503 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN5O75503 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN5O75503 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN5O75503 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLN5O75503 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN5O75503 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLN5O75503 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN5O75503 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN5O75503 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLN5O75503 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLN5O75503 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN5O75503 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLN5O75503 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN5O75503 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN5O75503 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN5O75503 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN5O75503 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLN5O75503 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN5O75503 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN5O75503 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLN5O75503 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN5O75503 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN5O75503 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN5O75503 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN5O75503 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN5O75503 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN5O75503 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN5O75503 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN5O75503 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN5O75503 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN5O75503 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN5O75503 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN5O75503 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN5O75503 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN5O75503 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN5O75503 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN5O75503 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN5O75503 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN5O75503 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN5O75503 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN5O75503 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN5O75503 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN5O75503 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN5O75503 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN5O75503 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN5O75503 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN5O75503 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN5O75503 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN5O75503 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN5O75503 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN5O75503 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN5O75503 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN5O75503 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN5O75503 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN5O75503 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN5O75503 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN5O75503 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN5O75503 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN5O75503 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN5O75503 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN5O75503 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN5O75503 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN5O75503 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN5O75503 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLN5O75503 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN5O75503 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN5O75503 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN5O75503 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN5O75503 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLN5O75503 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN5O75503 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLN5O75503 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms