Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS26AO75436 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS26AO75436 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VPS26AO75436 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS26AO75436 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms