Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK1O75385 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ULK1O75385 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ULK1O75385 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ULK1O75385 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ULK1O75385 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ULK1O75385 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ULK1O75385 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK1O75385 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK1O75385 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ULK1O75385 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ULK1O75385 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ULK1O75385 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ULK1O75385 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ULK1O75385 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ULK1O75385 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ULK1O75385 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ULK1O75385 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ULK1O75385 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ULK1O75385 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ULK1O75385 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ULK1O75385 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ULK1O75385 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ULK1O75385 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ULK1O75385 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ULK1O75385 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ULK1O75385 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ULK1O75385 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ULK1O75385 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ULK1O75385 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ULK1O75385 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ULK1O75385 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ULK1O75385 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ULK1O75385 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ULK1O75385 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ULK1O75385 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ULK1O75385 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ULK1O75385 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ULK1O75385 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ULK1O75385 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ULK1O75385 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ULK1O75385 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ULK1O75385 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ULK1O75385 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ULK1O75385 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ULK1O75385 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ULK1O75385 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ULK1O75385 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ULK1O75385 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ULK1O75385 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ULK1O75385 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ULK1O75385 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ULK1O75385 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ULK1O75385 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ULK1O75385 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ULK1O75385 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ULK1O75385 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ULK1O75385 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ULK1O75385 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ULK1O75385 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ULK1O75385 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ULK1O75385 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ULK1O75385 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK1O75385 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK1O75385 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK1O75385 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK1O75385 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK1O75385 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ULK1O75385 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ULK1O75385 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ULK1O75385 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ULK1O75385 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ULK1O75385 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ULK1O75385 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ULK1O75385 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ULK1O75385 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ULK1O75385 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ULK1O75385 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ULK1O75385 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ULK1O75385 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ULK1O75385 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ULK1O75385 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ULK1O75385 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ULK1O75385 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ULK1O75385 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ULK1O75385 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ULK1O75385 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ULK1O75385 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ULK1O75385 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ULK1O75385 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ULK1O75385 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ULK1O75385 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ULK1O75385 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ULK1O75385 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ULK1O75385 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ULK1O75385 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ULK1O75385 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ULK1O75385 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ULK1O75385 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ULK1O75385 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms