Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOL3O60936 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOL3O60936 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOL3O60936 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOL3O60936 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOL3O60936 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOL3O60936 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOL3O60936 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOL3O60936 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOL3O60936 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOL3O60936 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOL3O60936 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOL3O60936 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOL3O60936 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOL3O60936 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOL3O60936 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOL3O60936 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOL3O60936 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOL3O60936 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOL3O60936 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOL3O60936 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOL3O60936 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOL3O60936 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOL3O60936 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOL3O60936 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOL3O60936 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOL3O60936 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOL3O60936 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOL3O60936 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOL3O60936 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOL3O60936 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOL3O60936 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOL3O60936 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOL3O60936 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOL3O60936 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOL3O60936 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOL3O60936 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOL3O60936 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOL3O60936 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOL3O60936 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOL3O60936 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOL3O60936 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOL3O60936 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOL3O60936 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOL3O60936 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOL3O60936 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOL3O60936 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOL3O60936 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOL3O60936 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOL3O60936 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOL3O60936 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOL3O60936 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOL3O60936 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOL3O60936 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOL3O60936 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOL3O60936 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOL3O60936 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOL3O60936 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOL3O60936 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOL3O60936 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOL3O60936 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOL3O60936 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOL3O60936 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOL3O60936 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOL3O60936 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOL3O60936 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOL3O60936 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOL3O60936 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOL3O60936 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOL3O60936 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOL3O60936 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOL3O60936 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOL3O60936 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOL3O60936 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOL3O60936 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOL3O60936 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOL3O60936 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOL3O60936 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOL3O60936 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOL3O60936 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOL3O60936 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOL3O60936 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOL3O60936 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOL3O60936 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOL3O60936 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOL3O60936 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOL3O60936 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOL3O60936 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOL3O60936 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOL3O60936 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOL3O60936 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NOL3O60936 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOL3O60936 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOL3O60936 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOL3O60936 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOL3O60936 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOL3O60936 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOL3O60936 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOL3O60936 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOL3O60936 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms