Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPX2O60687 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRPX2O60687 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRPX2O60687 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRPX2O60687 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms