Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NME2P1O60361 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NME2P1O60361 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME2P1O60361 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NME2P1O60361 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms